Serwisy internetowe Uniwersytetu Warszawskiego Nie jesteś zalogowany | zaloguj się


Zakład Ekofizjologii Molekularnej Roślin

Witamy na wiki Wydziału Biologii Uniwersytetu Warszawskiego

Spis treści

Kierownik:

Prof. dr hab. Paweł Sowiński (+48 22) 55 43 015;
e-mail: pawes@biol.uw.edu.pl


Profesorowie emerytowani:

Prof. dr hab. Alina Kacperska-Lewak (+48 22) 55 43 121;
e-mail: alka@biol.uw.edu.pl
Prof. dr hab. Stanisław Lewak (+48 22) 55 43 123;
e-mail: slewak@biol.uw.edu.pl


Pracownicy:

Barbara Dobrska (+48 22) 55 43 125;
e-mail: basiad@biol.uw.edu.pl
Mgr Elżbieta Głuchowska (+48 22) 55 43 018;
e-mail: gluel@biol.uw.edu.pl
Dr Bożenna Maciejewska (+48 22) 55 43 016;
e-mail: bozma@biol.uw.edu.pl
Prof. dr hab. Andrzej Podstolski (+48 22) 55 43 019;
e-mail: apo@biol.uw.edu.pl
Dr Danuta Solecka (+48 22) 55 43 126;
e-mail: solecka@biol.uw.edu.pl

Dr Jarosław Szczepanik (+48 22) 55 43 118;
e-mail: jarossz@biol.uw.edu.pl


Doktoranci:

Mgr Maciej Jończyk (+48 22) 55 43 118;
e-mail: mjonczyk@biol.uw.edu.pl 
 


Problematyka badawcza:

Molekularne mechanizmy wrażliwości kukurydzy na chłód:
  • analiza porównawcza wzoru ekspresji genów z użyciem mikromacierzy w liściach siewek kukurydzy poddanych działaniu chłodu
  • identyfikacja genów związanych z wrażliwością kukurydzy na chłód
  • analiza informatyczna sekwencji nukleotydowych potencjalnych obszarów regulatorowych wybranych genów

Projekt realizowany we współpracy z dr. hab. Janem Fronkiem i dr Joanną Trzcińską-Danielewicz (Zakład Biologii Molekularnej UW), dr Anną Bilską i mgr Alicją Sobkowiak (Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin w Radzikowie) oraz zespołem prof. Piotra Zielenkiewicza (Zakład Bioinformatyki IBB PAN).

Transport związków organicznych w roślinach.
  • transport międzykomórkowy i dalekodystansowy produktów fotosyntezy u roślin C4
  • załadowanie floemu u traw
  • własności kinetyczne przenośników sacharozy z roślin wyższych wyrażonych w drożdżach
Regulacja biosyntezy związków fenolowych w roślinach.
  • Nieoksydacyjna droga biosyntezy aldehydu salicylowego, jego przemiany i udział w biosyntezie kwasu salicylowego.
  • Charakterystyka enzymów uczestniczących w biosyntezie aldehydu i kwasu salicylowego.
Hormonalna regulacja morfogenezy roślin w kulturach in vitro.
Regulacja biosyntezy metabolitów wtórnych w hodowlach tkanek roślinnych in vitro.
Wykorzystanie zawiesiny komórkowej do badania odporności na stresy.
Reakcje roślin na stresowe czynniki środowiska - rola ściany komórkowej.

 

Stosowane techniki

  • mikromacierze oligonukleotydowe
  • analiza bioinformatyczna, anotacja funkcjonalna z użyciem systemu Gene Ontology
  • przyżyciowe obserwacje transportu symplastycznego barwników fluorescencyjnych (CMNB caged fluoresceine, karboksyfluoresceina) w liściach traw C4 z użyciem mikroskopu konfokalnego
  • mikroskopia świetlna, fluorescencyjna, konfokalna, elektronowa skaningowa
  • immunocytochemia (immunogold, immunofluorescencja)
  • mikroautoradiografia
  • przyżyciowe badania transportu produktów fotosyntezy z użyciem izotopów węgla 14C i 11C
  • wykrywanie programowanej śmierci komórkowej metodą TUNEL
  • chromatografia HPLC i FPLC
  • metody biochemii białek
  • elektroforeza (natywna, SDS, IEF)
  • oznaczenia aktywności enzymów in vitro, in vivo i in muro
  • hodowla komórekin vitro

 

Zajęcia dydaktyczne


Ćwiczenia

- Fizjologia roślin "D", udział w wykładach i ćwiczeniach
- Fizjologia roślin "M2", udział w wykładach i ćwiczeniach
- Hodowla komórek i tkanek roślinnych i zwierzęcych (część roślinna - wykład i ćwiczenia)
- Statystyka I i II - udział w ćwiczeniach

Fakultety

- Techniki biologii eksperymentalnej roślin
- Kultury tkanek roślinnych in vitro
- Ekofizjologia molekularna roślin

Wykłady kursowe

- Fizjologia roślin "D"
- Fizjologia roślin "M2"
- Stres abiotyczny (3 h), Studium podyplomowe

Wykłady monograficzne

- Metabolity wtórne roślin
- Regulatory wzrostu i rozwoju roślin
- Kultury tkanek roślinnych in vitro
- Transport związków organicznych i sygnalizacja systemiczna (30 h), co dwa lata
- Transport międzykomórkowy u roślin (15 h), co dwa lata
- Ściana komórki roślinnej (15 h)


 

Przykładowe prace licencjackie, magisterskie i doktorskie

Prace licencjackie
  • Jarochowska E. (2007) Zmiany zawartości kalozy pod wpływem chłodu w liściach traw reprezentujących różne podtypy fotosyntezy C4
  • Toński M. (2007) Lokalizacja aktywności endotransglikozylazy/hydrolazy ksyloglukanów w ścianach komórkowych liści rzepaku
  • Kacprzak (2007) Identyfikacja aktywności metyloesterazy pektyn na żelu poliakrylamidowym
  • Jędrzejewska-Szmek K. (2007) Wpływ immobilizacji komórek w kulturze zawiesinowej tytoniu (Nicotiana tabacum) na wytwarzanie skopoletyny
  • Grzywacz A. (2006) Zmiany zawartości białek ściany komórkowej w aklimatyzowanych i deaklimatyzowanych liściach rzepaku ozimego
  • Kijeńska M. (2005) Wybrane metody spektroskopowe w analizie metabolitów wtórnych na przykładzie alkaloidów
  • Kubiak K. (2005) Właściwości przenośników sacharozy biorących udział w procesie załadowania floemu u roślin wyższych
  • Szczerba A. (2004) Ustalenie warunków uprawy grzyba Lentinus edodes w warunkach laboratoryjnych
  • Barańska K. (2003) Tworzenie i eliminacja plazmodesm, rozwój i przystosowanie roślin do zmieniającego się środowiska
  • Dąbrowska J. (2002) Charakterystyka białek ściany komórkowej roślin rzepaku poddanych działaniu różnych czynników stresowych
  • Przybysz D. (2002) Właściwości mechaniczne ściany komórkowej roślin rzepaku poddanych działaniu różnych czynników stresowych

Prace magisterskie
  • Poniatowski P. (2011) Modyfikacje aktywności metyloesteraz pektyn w liściach kukurydzy pod wpływem chłodu
  • Smoleńska A. (2010) Akumulacja trehalozy i sacharozy w roślinach kukurydzy (Zea mays L.) podczas stresu chłodu
  • Somerfeld A.  (2010) Obecność antocyjanów w siewkach kukurydzy podczas stresu chłodu
  • Kacprzak J. (2009) Aktywność metyloesteraz pektyn w aklimatyzowanych i deaklimatyzowanych liściach rzepaku
  • Randak I. (2009) Krioprezerwacja tkanki kalusowej lnu zwyczajnego (Linum usitatissimum) hodowanej in vitro techniką kapsułkowania-dehydratacji
  • Dziewulska A. (2009) Mechanizmy transportu metabolitów fotosyntezy typu C4 u traw
  • Jarochowska E. Charakterystyka genetycznego podłoża wrażliwości na niską temperaturę siewek trzech linii kukurydzy (w realizacji)
  • Grzywacz A. (2008) Zmiany aktywności ekspansyn w ścianach komórkowych liści rzepaku podczas aklimatyzacji i deaklimatyzacji roślin
  • Krzywińska E. (2008) Charakterystyka kinetyczna przenośników sacharozy wyrażonych w drożdżach
  • Kozłowski T. (2007) Aktywność b-glikozydaz uArabidopsis thaliana po infekcji Pseudomonas syringae
  • Pasikowska M. (2006) Rola aldehydu salicylowego w indukcji odporności na Pseudomonas syringae u Arabidopsis thaliana
  • Prekaniak A. (2006) Zmiany aktywności syntazy aldehydu salicylowego w zawiesinie komórkowej BY-2 i roślinach A. thaliana pod wpływem czynników stresowych
  • Barańska K. (2006) Wpływ warunków świetlnych środowiska na ultrastrukturę liści i fotosyntezę traw C4
  • Szczerba A. (2006) Immunomodulująca aktywność preparatów z orientalnych grzybów Shiitake i Maitake
  • Al Esber K. (2005) Rola melatoniny w usuwaniu skutków stresu oksydacyjnego wywołanego jonami ołowiu w korzeniach jęczmienia (Hordeum vulgare L.)
  • Czuroń A. (2005) Aktywność auksynowa melatoniny
  • Wójcik A. (2004) Wpływ auksyn i cytokinin na organogenezę u dziurawca zwyczajnego (Hypericum perforatum) w warunkach kultur in vitro
  • Godoń K. (2004) Stres oksydacyjny w korzeniach cebuli (Allium cepa L.), ochronne działanie melatoniny


Prace doktorskie
  • Jarosław Szczepanik (2011) Mechanizmy transportu międzykomórkowego u wiechlinowatych z fotosyntezą typu C4
  • Kamil Godoń (2008) Rola i przemiany aldehydu salicylowego w Arabidopsis thaliana
  • Jacek Malinowski (2004) Charakterystyka syntazy aldehydu salicylowego i jej udział w biosyntezie kwasu salicylowego w tytoniu
  • Renata Dębowska (2002) Charakterystyka oksydaz polifenolowych z kultury zawiązków pędowych Vanilla planifolia


Proponowane tematy prac

Prace licencjackie (teoretyczne z niewielką częścią eksperymentalną)

Opiekun dr hab. Paweł Sowiński, prof. UW:

  • Sygnalizacja systemiczna u roślin
  • Wpływ stresów abiotycznych na załadowanie floemu u roślin
  • Mechanizmy transportu międzykomórkowego u roślin
  • Szlaki sygnalizacji z udziałem trehalozy u bakterii, drożdży i roślin wyższych
  • Wykorzystanie metod genomiki funkcjonalnej w fizjologii roślin

Opiekun dr Danuta Solecka:

  • Białka ściany komórkowej
  • Aktywność "antifreeze" białek ściany
  • Specyfika budowy ścian u traw
  • Aktywność enzymów ścian komórkowych u traw

Prace magisterskie (eksperymentalne)
opiekun dr hab. Paweł Sowiński, prof. UW:

  • Hamowanie transportu symplastycznego przez stresy abiotyczne
  • Własności kinetyczne przenośników sacharozy u roślin
osobiste